La temporada tres continúa 67 días después del accidente. La temporada comienza donde la segunda temporada termino: tres de los sobrevivientes del accidente son mantenidos en cautiverio por "Los Otros". Más historias de Los Otros, así como la Iniciativa DHARMA, se revelan. Los sobrevivientes sufren amenazas continuas de sus enemigos, y también de sus amigos. La tercera temporada ocurre en 26 días.

SINOPSIS: Locke, Desmond y el Sr. Eko han sobrevivido a la explosión de la escotilla. Jack, Kate y Sawyer, por su parte, están en cautiverio como prisioneros de Los Otros. Al poco, Kate y Sawyer consiguen escapar gracias a la ayuda de Jack, que le había tendido una trampa a Ben, el líder de Los Otros y personaje que antes se había hecho llamar Henry Gale. Ellos dos consiguen huir, pero Jack debe quedarse solo. Con el tiempo, empieza a sentir algo por Juliet, a pesar de que ella es uno de sus captores y de que sus lealtades no están claras. Más tarde Kate y Sawyer consiguen regresar al campamento, y convencen a Locke y a Sayid para viajar a través de la isla e intentar liberar a Jack. Su sorpresa es que, cuando llegan, Jack parece tener un trato amistoso con Los Otros. Hablan con él y Locke destruye el submarino de Los Otros, lo que causa un gran revuelo. Entonces Los Otros (acompañados de Locke, que necesita encontrar respuestas) desaparecen sin dejar rastro, y Kate, Sayid, Jack y la propia Juliet regresan al campamento. La presencia de esta última causa un gran malestar, pero Jack la defiende y el resto deciden darle un voto de confianza, que de todas formas se acabará cuando Sawyer (gracias a Locke) consiga demostrar que ella sigue al servicio de Ben. Finalmente, se descubre que ella está actuando a favor de Ben en contra de su propia voluntad, y tienden una trampa a Los Otros, consiguiendo como resultado matar a varios de ellos, así como desbloquear la señal de radio que imposibilitaba las comunicaciones, para finalmente ponerse en contacto, gracias a un teléfono vía satélite perteneciente a una paracaidista llamada Naomi, con un barco que aparentemente les va a rescatar.

EPISODIOS:

3x01 A Tale of two Cities (Historia de dos Ciudades)
3x02 The Glass Ballerina (La Bailarina de Cristal)
3x03 Further Instructions (Instrucciones)
3x04 Every man for Himself (No te Preocupes por los Demás)
3x05 The Cost of Living (El Precio de Vivir)
3x06 I do (Acepto)
3x07 Not in Portland (No tan Cerca de Portland)
3x08 Flashes Before Your Eyes (Tu Vida Ante tus Ojos)
3x09 Stranger in Strange Land (Extraño en Tierra Extraña)
3x10 Tricia Tanaka is Dead (Tricia Tanaka Está muerta)
3x11 Enter 77 (Ingrese 77)
3x12 Par Avion (Mensaje Aéreo)
3x13 The man From Tallahassee (El Hombre de Tallahassee)
3x14 Exposé (Expuesto)
3x15 Left Behind (Dejada Atrás)
3x16 One of us (Una de Nosotros)
3x17 Catch-22 (rampa-22)
3x18 D.O.C. (Fecha de Concepción)
3x19 The Brig (Doble Venganza)
3x20 The Man Behind the Courtain (El Hombre Detrás de la Cortina)
3x21 Greatest Hits (Grandes Éxitos)
3x22 Through the Looking Glass - Part 1 (A Través del Espejo - Parte 1)
3x23 Through the Looking Glass - Part 2 (A Través del Espejo - Parte 2)